Nas últimas décadas o Brasil tem alcançado um aumento expressivo no número de publicações científicas, mas percebe-se que grande parte das pesquisas desenvolvidas não se converte em resultados práticos, na busca pela inovação e pela resolução dos problemas de empresas ou da sociedade em geral. Neste sentido, o objetivo do estudo é investigar como as instituições públicas poderiam otimizar os recursos investidos em pesquisa e inovação, além de validar um modelo de planejamento da pesquisa científica e tecnológica na RFEPCT, objetivando resultados mais efetivos para as demandas da sociedade. Para tanto, foi realizada uma investigação junto a 290 pesquisadores atuantes na RFEPCT, sendo utilizada a técnica de modelagem de equações estruturais para validar um modelo heurístico de planejamento. Os resultados contribuem para a adoção de novas práticas de planejamento das pesquisas na RFEPCT, considerando o desenvolvimento de pesquisas mais relevantes, capazes de gerar maiores impactos científicos, econômicos e sociais.