A quantificação de estruturas que são caracterizadas por coloração específica em tecidos animais e vegetais é importante na pesquisa biológica e biomédica moderna. Na maioria das vezes, essas análises ainda são realizadas de maneira manual devido à pouca disponibilidade de softwares gratuitos e eficientes para tal finalidade. Neste sentido, o trabalho se propôs a modelar e desenvolver de um software para quantificar estruturas coradas em imagens de tecidos animais e vegetais de maneira precisa, rápida e eficiente.