É evidente a degradação sofrida pelo meio ambiente devido a ação antrópica. Esta depauperação ocorre, pois o ser humano tem impactado diretamente a vida microbiana responsável pelo equilíbrio do funcionamento de todo ecossistema. A educação ambiental, através da disciplina de Microbiologia, surge como forte aliado no processo de conscientizar a sociedade atual. Neste trabalho é apresentado uma proposta de integração de conteúdos através de ferramentas de apoio ao ensino a distância.